בכתב יד קדשו של האריז”ל נמצא כתוב ש”טוב מאוד” ללכת לציון רבי יונתן בן עוזיאל. ואמרי אינשי שציון יונתן בן עוזיאל הינו מסוגל לתפילה על זיווג, אלא דלעיתים לא סגי במה שהולכים להתפלל לשם פעם אחת וצריכים פעמיים או שלושה פעמים. יש מי שהמליץ לחשוכי בנים, להתפלל על ציון רבי יונתן בן עוזיאל, ולקבל על עצמם שכאשר תבוא הישועה יקראו לבניהם “יונתן”